Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-EP13747 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms