Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT13P13646 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT13P13646 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT13P13646 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT13P13646 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms