Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARGP13631 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARGP13631 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARGP13631 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARGP13631 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARGP13631 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARGP13631 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARGP13631 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARGP13631 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARGP13631 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms