Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms