Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH1P12830 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH1P12830 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH1P12830 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH1P12830 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH1P12830 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH1P12830 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH1P12830 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH1P12830 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH1P12830 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH1P12830 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH1P12830 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms