Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms