Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms