Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP3P10745 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP3P10745 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP3P10745 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP3P10745 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP3P10745 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP3P10745 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP3P10745 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP3P10745 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms