Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX5BP10606 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX5BP10606 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX5BP10606 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX5BP10606 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX5BP10606 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms