Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HKR1P10072 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HKR1P10072 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HKR1P10072 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms