Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI3P10071 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI3P10071 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI3P10071 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI3P10071 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI3P10071 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI3P10071 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI3P10071 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI3P10071 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI3P10071 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI3P10071 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI3P10071 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms