Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR29P0C7W0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms