Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC6P09630 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC6P09630 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC6P09630 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC6P09630 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC6P09630 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC6P09630 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC6P09630 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC6P09630 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms