Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NGFRP08138 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NGFRP08138 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NGFRP08138 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NGFRP08138 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NGFRP08138 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NGFRP08138 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NGFRP08138 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NGFRP08138 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NGFRP08138 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms