Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFMP07197 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFMP07197 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFMP07197 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFMP07197 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFMP07197 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFMP07197 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFMP07197 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFMP07197 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFMP07197 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFMP07197 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFMP07197 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFMP07197 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms