Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3DP05423 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms