Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms