Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC2P02655 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC2P02655 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC2P02655 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC2P02655 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC2P02655 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC2P02655 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC2P02655 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC2P02655 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC2P02655 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC2P02655 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC2P02655 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC2P02655 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC2P02655 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOC2P02655 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOC2P02655 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms