Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms