Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-17P01599 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms