Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX7O95931 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX7O95931 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX7O95931 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX7O95931 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX7O95931 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX7O95931 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms