Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC2O95714 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC2O95714 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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HERC2O95714 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC2O95714 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HERC2O95714 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HERC2O95714 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HERC2O95714 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HERC2O95714 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HERC2O95714 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HERC2O95714 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC2O95714 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC2O95714 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC2O95714 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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