Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms