Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRATO95237 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRATO95237 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRATO95237 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRATO95237 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRATO95237 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRATO95237 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRATO95237 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRATO95237 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRATO95237 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRATO95237 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRATO95237 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRATO95237 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms