Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4BO95155 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4BO95155 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms