Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCF11O94913 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCF11O94913 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCF11O94913 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCF11O94913 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCF11O94913 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCF11O94913 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCF11O94913 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCF11O94913 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCF11O94913 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCF11O94913 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCF11O94913 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCF11O94913 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PCF11O94913 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PCF11O94913 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCF11O94913 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PCF11O94913 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PCF11O94913 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms