Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms