Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL5O76039 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
CDKL5O76039 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms