Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCATO75600 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCATO75600 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCATO75600 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCATO75600 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCATO75600 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCATO75600 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCATO75600 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCATO75600 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCATO75600 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCATO75600 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCATO75600 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCATO75600 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCATO75600 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCATO75600 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCATO75600 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCATO75600 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCATO75600 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms