Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX16O60231 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX16O60231 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DHX16O60231 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DHX16O60231 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX16O60231 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX16O60231 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms