Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRC1O43663 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRC1O43663 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRC1O43663 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRC1O43663 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRC1O43663 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRC1O43663 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRC1O43663 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRC1O43663 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRC1O43663 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRC1O43663 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRC1O43663 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRC1O43663 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms