Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms