Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms