Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PIK3C2AO00443 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms