Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIP1O00291 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIP1O00291 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIP1O00291 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIP1O00291 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIP1O00291 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIP1O00291 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms