Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVH48-1M5A8F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms