Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOC4-APOC2K7ER74 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms