Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L12C9JPN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L12C9JPN9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms