Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms