Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms