Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC162PA2VCL2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms