Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD3A2A2Y4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms