Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms