Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC106872.8-201ENST00000507651 684 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MIR99AHG-220ENST00000635845 1588 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC004801.4-201ENST00000546738 3112 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NFASC-223ENST00000513543 3974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC00662-201ENST00000561521 2480 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL356750.1-201ENST00000623911 2496 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FLJ40194-201ENST00000322227 2317 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ALS2-206ENST00000467448 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MTIF2-204ENST00000403721 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TBX22-201ENST00000373294 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 INSC-203ENST00000424273 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZNF793-209ENST00000589319 1915 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BTN3A1-208ENST00000476549 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HNRNPA1P61-201ENST00000342073 924 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RAB15-202ENST00000426039 683 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GNGT2-204ENST00000511277 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC38A3-206ENST00000614032 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC6A12-202ENST00000397296 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BARD1-211ENST00000613706 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ATAD3C-201ENST00000378785 3859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CT55-202ENST00000344129 1728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TTC27-201ENST00000317907 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CYP4F35P-201ENST00000582957 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FAM131B-201ENST00000409222 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CYP4A22-207ENST00000620131 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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