Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIAS3Q9Y6X2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIAS3Q9Y6X2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIAS3Q9Y6X2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIAS3Q9Y6X2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms