Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MAP3K4Q9Y6R4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms