Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE2Q9Y5Z0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms