Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms