Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD2APQ9Y5K6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms