Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms